Understanding DNA hairpins opening rates by mesoscopic model

  1. Marty Roda, Marta 1
  2. Cuesta López, Santiago 1
  3. Dahlen, Oda 2
  4. Erp, Titus S. van 2
  1. 1 Universidad de Burgos
    info

    Universidad de Burgos

    Burgos, España

    ROR https://ror.org/049da5t36

  2. 2 Norwegian University of Science and Technology
    info

    Norwegian University of Science and Technology

    Trondheim, Noruega

    ROR https://ror.org/05xg72x27

Libro:
II Jornadas de Doctorandos de la Universidad de Burgos: Universidad de Burgos. 10 y 11 de diciembre de 2015
  1. Sarabia Peinador, Luis Antonio (dir.)
  2. Iglesias Río, Miguel Ángel (coord.)

Editorial: Servicio de Publicaciones e Imagen Institucional ; Universidad de Burgos

ISBN: 84-16283-16-8 978-84-16283-18-7 84-16283-18-4

Año de publicación: 2015

Páginas: 623-628

Congreso: Jornadas de Doctorandos de la Universidad de Burgos (2. 2015. Burgos)

Tipo: Aportación congreso

Resumen

Hemos aplicado una adaptación del modelo Peyrard-Bishop-Dauxois (PBD) para estudiar la desnaturalización de horquillas de ADN para las cuales hay disponibles datos experimentales. Este es uno de los primeros estudios cuantitativos en el cual, resultados dinámicos obtenidos del modelo mesoscópico, se compran con experimentos. Nuestros resultados muestran que, añadiendo una barrera entropica al potencial del modelo PBD, podemos reproducir de forma precisa los resultados experimentales.