Multivariate classification of gene expression microarray data
- Botella Pérez, Cristina
- Ricard Boqué Martí Director/a
- Joan Ferré Baldrich Director/a
Universitat de defensa: Universitat Rovira i Virgili
Fecha de defensa: 26 de de maig de 2010
- Luis Antonio Sarabia Peinador President
- María Soledad Larrechi García Secretari/ària
- Santiago Garcia Vallvé Vocal
- Alberto José Ferrer Riquelme Vocal
- Enric Comas Lou Vocal
Tipus: Tesi
Resum
L'expressiódels gens obtinguts de l'anàliside microarrays s'utilitza en molts casos, per classificar les cèllules. En aquestatesi, unaversióprobabilística del mètodeDiscriminant Partial Least Squares (p-DPLS)s'utilitza per classificar les mostres de les expressions delsseus gens. p-DPLS esbasa en la regla de Bayes de la probabilitat a posteriori. Aquestsclassificadorssónforaçats a classficarsempre.Per superaraquestalimitaciós'haimplementatl'opció de rebuig.Aquestaopciópermetrebutjarlesmostresamb alt riscd'errors de classificació (és a dir, mostresambigüesi outliers).Aquestaopció de rebuigcombinacriterisbasats en els residuals x, el leverage ielsvalorspredits. A més,esdesenvolupa un mètode de selecció de variables per triarels gens mésrellevants, jaque la majoriadels gens analitzatsamb un microarraysónirrellevants per al propòsit particular de classificacióI podenconfondre el classificador. Finalment, el DPLSs'estenen a la classificació multi-classemitjançant la combinació de PLS ambl'anàlisidiscriminant lineal.