Multivariate classification of gene expression microarray data
- Botella Pérez, Cristina
- Ricard Boqué Martí Directeur/trice
- Joan Ferré Baldrich Directeur/trice
Université de défendre: Universitat Rovira i Virgili
Fecha de defensa: 26 mai 2010
- Luis Antonio Sarabia Peinador President
- María Soledad Larrechi García Secrétaire
- Santiago Garcia Vallvé Rapporteur
- Alberto José Ferrer Riquelme Rapporteur
- Enric Comas Lou Rapporteur
Type: Thèses
Résumé
L'expressiódels gens obtinguts de l'anàliside microarrays s'utilitza en molts casos, per classificar les cèllules. En aquestatesi, unaversióprobabilística del mètodeDiscriminant Partial Least Squares (p-DPLS)s'utilitza per classificar les mostres de les expressions delsseus gens. p-DPLS esbasa en la regla de Bayes de la probabilitat a posteriori. Aquestsclassificadorssónforaçats a classficarsempre.Per superaraquestalimitaciós'haimplementatl'opció de rebuig.Aquestaopciópermetrebutjarlesmostresamb alt riscd'errors de classificació (és a dir, mostresambigüesi outliers).Aquestaopció de rebuigcombinacriterisbasats en els residuals x, el leverage ielsvalorspredits. A més,esdesenvolupa un mètode de selecció de variables per triarels gens mésrellevants, jaque la majoriadels gens analitzatsamb un microarraysónirrellevants per al propòsit particular de classificacióI podenconfondre el classificador. Finalment, el DPLSs'estenen a la classificació multi-classemitjançant la combinació de PLS ambl'anàlisidiscriminant lineal.