Multivariate classification of gene expression microarray data

  1. Botella Pérez, Cristina
Zuzendaria:
  1. Ricard Boqué Martí Zuzendaria
  2. Joan Ferré Baldrich Zuzendaria

Defentsa unibertsitatea: Universitat Rovira i Virgili

Fecha de defensa: 2010(e)ko maiatza-(a)k 26

Epaimahaia:
  1. Luis Antonio Sarabia Peinador Presidentea
  2. María Soledad Larrechi García Idazkaria
  3. Santiago Garcia Vallvé Kidea
  4. Alberto José Ferrer Riquelme Kidea
  5. Enric Comas Lou Kidea

Mota: Tesia

Teseo: 300142 DIALNET lock_openTDX editor

Laburpena

L'expressiódels gens obtinguts de l'anàliside microarrays s'utilitza en molts casos, per classificar les cèllules. En aquestatesi, unaversióprobabilística del mètodeDiscriminant Partial Least Squares (p-DPLS)s'utilitza per classificar les mostres de les expressions delsseus gens. p-DPLS esbasa en la regla de Bayes de la probabilitat a posteriori. Aquestsclassificadorssónforaçats a classficarsempre.Per superaraquestalimitaciós'haimplementatl'opció de rebuig.Aquestaopciópermetrebutjarlesmostresamb alt riscd'errors de classificació (és a dir, mostresambigüesi outliers).Aquestaopció de rebuigcombinacriterisbasats en els residuals x, el leverage ielsvalorspredits. A més,esdesenvolupa un mètode de selecció de variables per triarels gens mésrellevants, jaque la majoriadels gens analitzatsamb un microarraysónirrellevants per al propòsit particular de classificacióI podenconfondre el classificador. Finalment, el DPLSs'estenen a la classificació multi-classemitjançant la combinació de PLS ambl'anàlisidiscriminant lineal.