Multivariate classification of gene expression microarray data

  1. Botella Pérez, Cristina
Dirigida por:
  1. Ricard Boqué Martí Director/a
  2. Joan Ferré Baldrich Director/a

Universidad de defensa: Universitat Rovira i Virgili

Fecha de defensa: 26 de mayo de 2010

Tribunal:
  1. Luis Antonio Sarabia Peinador Presidente
  2. María Soledad Larrechi García Secretario/a
  3. Santiago Garcia Vallvé Vocal
  4. Alberto José Ferrer Riquelme Vocal
  5. Enric Comas Lou Vocal

Tipo: Tesis

Teseo: 300142 DIALNET lock_openTDX editor

Resumen

L'expressiódels gens obtinguts de l'anàliside microarrays s'utilitza en molts casos, per classificar les cèllules. En aquestatesi, unaversióprobabilística del mètodeDiscriminant Partial Least Squares (p-DPLS)s'utilitza per classificar les mostres de les expressions delsseus gens. p-DPLS esbasa en la regla de Bayes de la probabilitat a posteriori. Aquestsclassificadorssónforaçats a classficarsempre.Per superaraquestalimitaciós'haimplementatl'opció de rebuig.Aquestaopciópermetrebutjarlesmostresamb alt riscd'errors de classificació (és a dir, mostresambigüesi outliers).Aquestaopció de rebuigcombinacriterisbasats en els residuals x, el leverage ielsvalorspredits. A més,esdesenvolupa un mètode de selecció de variables per triarels gens mésrellevants, jaque la majoriadels gens analitzatsamb un microarraysónirrellevants per al propòsit particular de classificacióI podenconfondre el classificador. Finalment, el DPLSs'estenen a la classificació multi-classemitjançant la combinació de PLS ambl'anàlisidiscriminant lineal.